工作时间扭伤脚踝，现在正在治疗中，公司对治疗药物非常有限，为了维护我的合法权益

针对您提到公司拒绝为您申请工伤认定的情况，根据《工伤保险条例》第十七条规定，单位应在事故伤害发生之日起三十日内申请工伤认定。若单位未按规定申请，您可在一年内自行向劳动局提出申请。若单位拒绝配合提供相关材料或故意阻挠，您可通过劳动仲裁或诉讼途径维权，要求单位承担相应法律责任，确保您的工伤权益得到保障。
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在工伤认定期间，若公司提供的治疗资源有限，您有权选择更合适的医疗机构进行治疗。根据相关规定，工伤治疗应遵循必要、合理的原则。您可先与公司沟通，要求提供更充分的治疗资源；若无法满足，可自行选择合规医疗机构治疗，并保留好相关费用单据，以便后续向工伤保险基金或单位申请报销。
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从法律角度看，公司应确保工伤员工获得及时、必要的医疗救治。具体包括：及时为工伤员工申请工伤认定；在工伤认定期间，提供或协调必要的医疗资源；承担工伤员工治疗期间的合理医疗费用；确保工伤员工在治疗期间享受相应的工资待遇。若公司违反上述义务，工伤员工有权通过法律途径维护自身权益。